本发明提供了一种高通量数字病理切片自动扫描装置，包括用于存放待扫描切片的切片仓单元、用于对优先切片进行扫描的急诊仓单元、用于承载切片进行扫描的切片载物平台单元、用于对切片载物平台上的切片进行扫描的光学成像单元以及用于对切片仓单元与急诊仓单元的切片进行转运的转运单元，所述切片仓单元设有转台，所述转台设有若干层，每层绕转台中心间隔均匀地设有若干切片盒仓位，所述切片盒仓位内设有用于放置切片的切片盒，所述切片转运单元设有移动模块和用于抓取切片的切片抓取模块。本发明结构紧凑，能够容纳更多切片，进而实现连续自动化扫描，提高切片扫描效率；并且，可对优先切片进行扫描，进一步提高装置的灵活性和实用性。