本发明提供的一种火电机组深度余热利用耦合清洁能源热泵供热系统及运行方法，包括蒸汽水供热系统，清洁能源热泵供热系统，脱硫浆液闪蒸回收烟气余热热泵供热系统、循环水回收低压排汽潜热热泵供热系统、热网循环供回水系统和热网加热器；热网循环供回水系统分别与蒸汽水供热系统、清洁能源热泵供热系统、脱硫浆液闪蒸回收烟气余热热泵供热系统和循环水回收低压排汽潜热热泵供热系统连接，有效的解决了将清洁能源融入到热电联产机组中，使之高效耦合到现有供热系统中参与对外供热的问题，且提高了热电联产机组余热利用深度，有效的回收乏汽余热和排烟余热，提高供热机组经济性和能源利用率，降低机组供热成本和碳排放指标。