本发明涉及生物工程技术领域，公开了一种毛木耳多糖纳米硒复合物的制备方法，其包括如下步骤：S1、将毛木耳多糖溶液与亚硒酸钠溶液充分混合均匀，加入抗坏血环酸溶液，在进行水浴反应可得反应液体；S2、将步骤1所得反应液进行透析得到毛木耳多糖纳米硒复合物溶液；S3、将步骤2所得毛木耳多糖纳米硒复合物溶液冷冻干燥成粉末状固体，则可得到毛木耳多糖纳米硒复合物。本发明以毛木耳多糖作为稳定调控剂，以亚硒酸钠作为硒源，并对毛木耳多糖纳米硒复合物的制备进行优化，通过本发明工艺制备的毛木耳多糖纳米硒复合物具有粒径小、低毒性、稳定性好、有较强的抗氧化能力。