本发明公开了一种控制钢轨在线热处理后头部局部侧弯的方法，其采用热处理机组进行热处理，热处理机组配置有若干组侧导轮，所述热处理机组出口端的部分组侧导轮依次左右错位布置，相邻两组错位的侧导轮之间间隔1组未错位的侧导轮。本方法利用现有的辊道侧导轮实施错位布置，通过对钢轨施加弯曲变形，对钢轨头部局部侧弯起到矫正的作用；本方法能够在不增加额外成本前提下，通过实施侧导轮错位布置，有效控制钢轨在线热处理后的钢轨头部局部侧弯，使钢轨出热处理机组后头部最大局部侧弯小于30mm，有效地避免了钢轨偏出横移辊道导致判废，提升钢轨成材率。