本发明公开了一种基于着陆器的有人无人潜水器协同作业系统及方法，涉及海洋勘测技术领域，该系统包括载人潜水器支持母船、着陆器、载人潜水器和AUV集群；着陆器用于当AUV集群布放在第一作业区域时，监控AUV集群中每个AUV的定位信息，并发送至相应的AUV；载人潜水器支持母船用于当载人潜水器布放在第二作业区域时，监控载人潜水器的作业状态信息和定位信息，并发送至载人潜水器。本发明通过着陆器实现在不同区域的AUV集群和载人潜水器的精确定位，实现在3～4级海况下，同一艘载人潜水器支持母船搭载载人潜水器和数台AUV开展有人无人协同作业，提高作业效率。