本发明涉及一种基于双层改进云模型的配电自动化终端健康状态评估方法及系统。包括：通过配电主站采集第一次状态评估指标的原始数据，使用对应的由云模型发生器生成的云模型计算出各指标的隶属度，并且将配电自动化终端第一次状态评估中各指标的隶属度加权计算，得到第一层状态评估的隶属度；根据第一层状态评估的隶属度确定第一层状态，并且，若第一层是正常状态则判断该配电自动化终端为正常状态；否则，进行第二层状态评估并输出评估结果。本发明针对配电自动化终端状态评估指标的特点，选择特定的云模型计算评估指标每一个状态等级的隶属度，提高每个指标状态评估的准确度；可以很大程度上节约人力和物力的损耗，提高运维效率。