本申请公开一种航测精度确定方法和系统。其中航测精度确定方法包括：识别有效测量点，所述有效测量点包括无人机搭载的相机在对应航点的航测范围内，且未被遮挡的拍摄点；根据所述有效测量点、所述相机的物镜投影中心、所述相机相对于所述无人机的外方位旋转矩阵构建用于求解变化量矢量的变化量等式，所述变化量矢量用于描述所述有效测量点在各个方向向所述物镜投影中心产生的变化量；根据所述变化量等式求解所述变化量矢量；根据所述变化量矢量计算所述有效测量点的航测精度。本申请可以提高所得航测精度的准确性。