本发明公开一种全身动态PET成像的运动校正方法及系统，该方法包括：对于每次动态18F‑FDG PET/CT扫描，将10‑60分钟的列表模式数据重建为50个1分钟长的帧图像；以9‑10分钟的动态扫描列表模式数据重建的1个1分钟长的帧图像作为参考帧图像，将第一步生成的帧图像通过顺序地将每一个帧图像配准到其前一个邻接帧图像来与所述参考帧图像对齐，每个相邻帧图像之间的配准均基于运动场的微分表示；在完成所有帧图像的成对配准后，通过串联连续的运动场，得到每一帧图像的4‑D运动场，然后将重建生成的帧图像与导出的对应4‑D运动场进行变换，得到运动补偿帧图像。通过本发明校正后的SUV图像和Ki参数图像具有较高的图像质量。