本发明提供一种河道断面的单波束测量波束角效应的改正方法，包括：利用仪测水深回声数据最强回波对水深数据进行校对，对水温跃层进行SVP梯度改正，得到断面预处理数据集；对所述断面预处理数据集进行断面起点距计算，得到断面数据集；对所述断面数据集中的断面点按照断面点起伏形态进行区分，对断面点坡度影响最大的两个倾角进行坡度拟合；根据建立的数学几何模型，实现对河道断面的单波束测量波束角效应的水深改正；通过潮位改正，得到断面成果数据集；该法大大削弱单波束测深中人们常常忽略的波束角效应的影响，提高了单波束测深精度。