一种基于图神经网络的雷电预警方法，包括：选定多个观测点，对任一观测点确定一个待预测时刻，获取该待预测时刻的一组雷电活动信息，以及待预测时刻前的相应时段的一组气象数据以及一组雷电数据；将多个观测点构成的多组雷电活动信息、多组气象数据、多组雷电数据进行样本训练，构建相应的雷电活动预测的图神经网络模型；获取当前时刻的一组气象数据以及一组雷电数据，输入图神经网络模型，得到当前时刻对应的雷电活动信息。与现有技术相比，该模型从两个维度考虑了神经网络的结合，从变量的角度，对不同数据类型间的关系进行建模，挖掘变量间的潜在关系。从时间的角度，对不同时刻的数据向量进行建模，挖掘了不同时刻数据向量间的相互影响。