本发明公开了考虑可再生能源不确定性的IIES风险规避优化方法及系统，属于综合能源技术领域。本发明的考虑可再生能源不确定性的IIES风险规避优化方法，从历史数据中学习综合能源微系统IIES的均值和波动性，生成考虑可再生能源波动性的可再生能源场景，并对可再生能源场景进行聚类以及削减，选出典型场景；在典型场景中度量弃负荷条件风险价值以及经济成本，实现弃负荷风险的准确度量；进而根据风险偏好系数，对弃负荷条件风险价值和综合能源微系统IIES的经济成本进行复合优化，使得两者的复合优化值最小；从而可以根据复合优化值，对多能源设备的容量进行优化，实现综合能源微系统IIES风险规避优化，有效减少弃负荷的风险，方案科学、合理。