本发明公开了一种新型多功能集成的磁共振造影剂的制备方法及应用，涉及生物医学工程领域，磁共振造影剂内核为氟化碳纳米材料，氟化碳纳米材料表面有氨基醇和氮氧自由基。制备方法包括：S10、配制氟化碳纳米材料的乙醇分散液；S20、配制氮氧自由基的乙醇溶液和氨基醇的乙醇溶液；S30、在所述氟化碳纳米材料乙醇分散液中加入氮氧自由基的乙醇溶液；S40、加入所述氨基醇的乙醇溶液，S50、反应结束后离心洗涤，得到的沉淀物干燥，即得磁共振造影剂。氮氧自由基首选具有良好自由基稳定性和生物安全性的4‑氨基‑TEMPO；改善水分散性的氨基醇类化合物首选具有生物相容性和生物安全性的三羟甲基氨基甲烷。