本发明涉及原代细胞培养技术领域，公开了一种黑水虻胚胎细胞原代培养漂洗装置及方法，具体包括包括：用于为黑水虻的原代组织块提供原代培养漂洗场所的离心管；吹打漂洗原代组织块用的吸打装置，其外壁尺寸与离心管内壁尺寸一致，吹打漂洗原代组织块时紧密贴合离心管内壁；分离漂洗液的分离装置，其外壁尺寸与离心管内壁尺寸一致，分离漂洗液时紧密贴合离心管内壁。通过采用本方案中的黑水虻胚胎细胞原代培养漂洗装置及漂洗方法可以减少漂洗过程中黑水虻胚胎细胞被细菌真菌感染的概率，降低了黑水虻胚胎细胞污染的风险，提升了黑水虻胚胎细胞原代培养的成功率。