一种基于杂散磁通检测的电机故障诊断方法及系统，涉及电机故障诊断领域；其中电机故障诊断系统包括：杂散电磁数据采集器、故障诊断器、服务器及上位机，杂散电磁数据采集器用于采集待检测电机的杂散磁通信号，并将杂散磁通信号上传到故障诊断器；故障诊断器用于接收杂散磁通信号，将接收到的杂散磁通信号去噪后进行分类诊断处理，并将经分类诊断处理后生成的诊断结果发送到服务器；服务器用于接收诊断结果，以根据诊断结果生成可视化数据，并将可视化数据发送到上位机；上位机用于接收可视化数据并进行可视化展示。以此解决了现有的电机故障检测方法操作复杂，测试结果不准确，并存在影响电机设备运行可靠性和安全性的问题。