本发明公开了一种多模态癌症识别装置及应用，涉及医学人工智能领域，该装置包括数据输入模块、特征处理模块和定量分析模块；其中，输入模块的输出作为所述特征处理模块的输入，特征处理模块的输出作为所述定量分析模块的输入，定量分析模块采用定量分析网络计算癌症的概率。该装置在代谢指纹图谱和临床检测标志物的数据分析中的应用。提供了一种基于代谢指纹图谱和临床检测标志物的多模态癌症识别方法、装置、计算设备和应用，结合代谢以及代谢的正交信息准确识别早期癌症，快速判别癌症相关的代谢标志物，为癌症早筛、标志物筛选提供更好的解决方案。