本发明公开了一种多模型组合水文预报方法、系统及计算机存储介质，方法包括：基本水文模型筛选、基本预测序列获取、多元决策支撑信息选择、基本预测序列过程相似度计算、基本预测序列量值偏离度计算、基本预测序列综合权重计算和基本预测序列加权组合。本发明从多个角度评价筛选出合格的基本水文模型并获取预测序列，从历史水文时间序列中选择多元决策支撑信息与预测序列融合，以确定不同基本预测序列权重，最终加权组合多个基本预测序列获取水文时间序列多模型组合预报结果，通过在多模型组合预报方案确定过程中融入关键决策支撑信息，实现科学可靠的水文时间序列多模型组合预报。