本发明公开了高疏水介孔Y型分子筛及其制备方法，属于疏水分子筛技术领域。所述高疏水介孔Y型分子筛的孔径在2nm以上，具有介孔结构，晶胞参数范围为24.20~24.35Å，硅铝比小于80，吸水率小于5%，磷含量为0.1~1%；通过磷改性NaY分子筛，调变分子筛酸性，提高骨架的稳定性；通过无氧环境下用高温酸蒸汽处理，将脱铝、造介孔、收缩晶胞同步进行，能够缩短工艺流程，大幅度减少有机酸的用量，不会出现分子筛骨架坍塌的问题；利用弱碱中和分子筛表面的游离酸，脱除分子筛表面及孔腔内的游离铝及钠离子，通过高温水热处理，快速收缩晶胞，结合高温焙烧处理，降低分子筛的酸性，从而提高产品的疏水性能。