本发明公开了一种双向发酵刺梨酵素的制备方法，属于食品发酵技术领域。其首先对鲜刺梨原料进行挑选、清洗及剁碎,然后将刺梨与蜂蜜、糖混合发酵，通过配比原料入罐、接入药用真菌、恒温双向发酵、过滤、陈酿等步骤制得酵素；最后经调配，灌装、杀菌、包装，即得。本发明选择麦芽糖、白砂糖的混合糖，具有良好的保健作用，本发明利用双向发酵工艺，在发酵过程中接入不同的药用真菌，使发酵从原来的单向转变为双向性，发酵更加彻底，应用菌种的酶使药性基质的组织成分分解、变化、产生新的成分，从而形成新的性昧、功能不同的药性菌质或全性菌质，故具有双向性或多样性，经发酵后的刺梨酵素富含维生素C、SOD等多种特性成分，具有调节机体免疫功能、延缓衰老、美容养颜的功能，本发明酵素通过双向发酵技术将刺梨大分子转变为易被人体吸收的小分子，刺梨酵素养生功效更加明显，维生素C和SOD含量大幅增加，具有很好的市场应用前景。