本发明公开了一种立体生态混凝土制备方法及在黑臭水体治理中的应用，涉及黑臭水体治理技术领域，包括以下步骤：骨料初步筛，获取不同粒径骨料；选用载体，采用湿浸渍法制备硝酸钙缓释体；将选取的骨料、硝酸钙缓释体和水泥按照：水泥和砂粒的比例1:1～1:5，硝酸钙缓释体占总质量0.1％～5％配料后，搅拌获得混合料；向混合料加入适量水分，搅拌混合至粘稠状，倒入定制模具浇筑塑形；在混凝土砖块表面铺设生物填料层，经养护后制得立体生态混凝土。本发明通过构建可控释放硝酸钙的立体生态混凝土，其中缓释的钙离子去除导致水体发黑的硫化物和硫酸盐；利用缓释的硝酸盐作为电子受体激活水体中反硝化微生物，降解有机物；表面生物填料层有利于形成生物膜保持活性。