本发明公开了一种水溶性综合阻垢剂及其制备方法和在水处理中的应用，属于水处理技术领域。水溶性综合阻垢剂由丙烯酸和丙烯腈共聚制备，丙烯酸与丙烯腈的质量比为3~9：1。水溶性综合阻垢剂的制备方法为将水加热至80~85℃，向水中滴加丙烯酸‑丙烯腈混合溶液、引发剂水溶液和还原剂水溶液，滴加完毕后80~85℃保温反应30~50min，反应结束后，降温至20~30℃，得水溶性综合阻垢剂。水溶性综合阻垢剂克服了现有阻垢剂阻垢效果单一的弊端，具有良好的疏水效果和阻碳酸钙、硫酸钙和磷酸钙垢能力，制备工艺简单，单体残余量少，转化率高，合成成本低，易于推广，具有良好的应用前景。