本发明提供了基于多任务学习的肝癌预后分析方法、系统及设备，方法包括：获取肝癌病例数据集；构建基于多任务神经网络的肝癌预后分析模型；利用肝癌病例数据集，对基于多任务神经网络的肝癌预后分析模型进行训练，得到训练好的基于多任务神经网络的肝癌预后分析模型；获取待预测的肝癌病例数据，并将待预测的肝癌病例数据输入至训练好的基于多任务神经网络的肝癌预后分析模型，获得肝癌病例的预测的各个时间点的生存状态，并估计术后生存时间；基于训练好的肝癌预后分析模型，进行危险因素筛选与风险评估。本发明采用基于多任务学习的肝癌预后分析方法，从而从根源上解决了现有的肝癌预后分析准确度低的问题。