本发明公开了一种面向直流配电控制系统的换流器运行控制系统，涉及换流器运行控制技术领域，包括服务器，服务器通讯连接有控制方式分析选择单元、转化方式分析选择单元、换流过程检测分析单元、运行质量评估单元；本发明是将换流器在进行电量转换时进行电源控制，根据电网当前执行任务进行合理控制方式选择，保证换流器的运行效率，同时在微网与外部电网脱离时能够保证换流器的任务量执行合格率，增强换流器对应任务量的执行效率；还将换流器在主从控制方式和对等控制方式的转换方式进行分析选择，以保证换流器所属微网的运行效率。