本发明涉及一种具有抗EV71病毒功能的灰树花低分子量多糖肽及其制备方法。所述制备方法具体为：将灰树花子实体低温烘干后粉碎成粗粉；向灰树花子实体粗粉中加入70vol%乙醇醇提2次；向灰树花70%乙醇提取物残渣中加入纯水提2次；水提滤液浓缩得到灰树花水提物，再加入95%乙醇醇沉2次，收集上清液经浓缩、干燥得到灰树花水提上清物；将灰树花水提上清物依次使用石油醚、乙酸乙酯、正丁醇进行萃取，再加入无水乙醇醇沉2次，收集醇沉物干燥后得到灰树花低分子量多糖肽。经体外细胞实验验证，本发明制备的灰树花低分子量多糖肽具有明显的抗EV71病毒活性。