本发明公开了一种地铁车站‑高架桥同位合建抗震韧性结构及设计方法，包括明挖基坑及其围护结构、双层双跨地铁车站结构和高架桥结构。地铁车站结构的中柱与高架桥结构的中间桥墩竖向共轴、纵向同距。叠层预制空心柱段与钢管混凝土芯柱共同组成地铁车站中柱，在提高中柱竖向承载能力的同时，具有显著优于现浇柱的层间变形能力，增强了地铁车站结构的抗震性能。高架桥的水平可滑动中间桥墩与两侧预应力摇摆桥墩共同承担竖向荷载，具有较强的抗倾覆能力和震后自复位功能。本发明地铁车站‑高架桥同位合建结构体系整体受力简单，抗震韧性较好，且占地小、造价低，具有较好的经济效益和社会价值。