本发明公开了一种中性点谐振接地时避雷器GPR安全限值计算方法及系统，根据变电站GPR反击站用避雷器的基本原理搭建10kV系统的仿真模型，确定不同消弧线圈配置方式下的避雷器受反击特性；记录避雷器在故障过程0.5s中的放电电流波形和两端电压波形；通过记录故障过程中避雷器两端的电压波形和放电电流波形，经卷积计算得到避雷器在GPR的反击下吸收的能量；通过记录故障过程中避雷器两端电压变化波形，确定10kV系统中性点经消弧线圈接地时GPR反击避雷器的机理，将确定线路对地电容数值带入仿真模型，将避雷器吸收能量与通流容量进行对比，校核避雷器在GPR反击下的安全性，得到不同线路对地电容下避雷器GPR安全限值。准确确定避雷器反击情况，避免安全事故和损失。