本发明涉及一种单片机控制的船舶尾气脱硝系统，包括：氨空气混合器、脱硝反应器、SCR催化剂、喷氨装置、尿素溶液储罐、温度传感器、差压传感器、NOx传感器和嵌入式控制系统；尿素溶液储罐通过喷氨装置与氨空气混合器相连，氨空气混合器的烟气出口与脱硝反应器的烟气进口相连接；脱硝反应器内置SCR催化剂。本发明的有益效果是：本发明通过嵌入式控制系统和传感器可对船舶尾气的温度、压力、NOx排放浓度进行实时检测，调整脱硝系统运行，有效控制NOx排放，具有较好的经济性与可行性。