本发明提供一种牵引变流器的水冷系统、方法、控制器及牵引系统，该系统包括：水泵，用于为所述水冷系统提供冷却液体；第一水冷散热器，安装于所述牵引变流器的整流模块，与所述水泵连接，用于利用所述水泵提供的冷却液体对所述牵引变流器的整流模块进行冷却；第二水冷散热器，安装于所述牵引变流器的逆变模块，与所述水泵连接，用于利用所述水泵提供的冷却液体对所述牵引变流器的逆变模块进行冷却；热交换器，与所述第一水冷散热器、所述第二水冷散热器连接，用于对所述第一水冷散热器、所述第二水冷散热器流出的冷却液体进行热交换。能够有效控制列车牵引变流器的整流模块和逆变模块的温度波动范围，避免温度波动范围较大而影响模块寿命。