本发明公开了一种基于多目标竞争关系量化的梯级电站发电与生态多目标协同优化方法和系统，该方法包括采集预定研究区域的基础数据；构建梯级电站发电与生态协同优化调度模型；以所述基础数据作为梯级电站发电与生态协同优化调度模型的输入，采用预定算法求解，获得Pareto非劣解集及调度方案集；构建多目标间竞争关系量化方法，并采用所述量化方法量化Pareto非劣解集包含的多目标间竞争关系；构建兼顾竞争关系的调度方案优选方法，并采用所述优选方法对调度方案进行优选，获得最终调度方案组合；基于最终调度方案进行模拟调度并与实际调度对比。本发明提高了调度方案决策效率，获得了更大的发电和生态效益，具有可行性、有效性及优越性。