本发明公开了一种治疗哮喘的药菌组合物及其制备方法与应用，本发明的组合物中各中药相配，使得治疗哮喘的作用增倍，从而有达到更好的治疗效果。本发明联合了Akkermansia Muciniphila菌。补充Akkermansia Muciniphila菌可以调节肠道菌群组成，恢复肠道菌群稳态。同时，Akkermansia muciniphila的添加可减少气道炎症。本发明药菌组合物在补充Akkerma nsia Muciniphila菌的来恢复哮喘引起的肠道菌群紊乱；同时，平喘方可入肺减少炎症的发生和发展，又通过调节已补充的Akkermansia Muciniphila菌进一步恢复肠道稳态，两者结合起到协同增效的作用，进而达到更好的治疗哮喘的目的。