一种多功能多肽聚合物及其制备方法和应用，其中多功能多肽聚合物包括以下原料：聚乙二醇，以及能使聚乙二醇完全反应的靶向抗菌肽；所述靶向抗菌肽的末端具有巯基，所述聚乙二醇为甲氧基封端、马来酰亚胺端基修饰的聚乙二醇，所述靶向抗菌肽末端的巯基与所述聚乙二醇的马来酰亚胺发生迈尔克加成反应合成得到多肽聚合物。本发明所采用的靶向抗菌肽由于其自组装抗菌性能较弱，通过接枝聚乙二醇后形成多肽聚合物，在中性条件下主要发挥抗污功效，减少细菌、蛋白等非特异性分子的粘附维护牙齿健康作用；一旦口腔pH发生变化，抗菌肽分子中的精氨酸、色氨酸会随着pH的变化表现出酸性自增强的抗菌功能，协同聚乙二醇的渗透功能，能有效杀灭有害菌群。