本发明涉及一种基于无源保护的主动配电网故障定位系统及其方法，该系统包括安装于主动配电网开关柜、环网柜的无源保护终端、安装于分布式电源接入点、配网系统电压母线的uPMU，无源保护终端和uPMU分别与故障定位主机连接，故障定位主机与配网调度自动化系统连接。该方法包括：根据分布式电源并网逆变器控制策略，建立受控电流源模型，得到分布式电源并网点阻抗支路模型；建立主动配电网序分量计算网络，以计算配网馈线线路的支路电流；无源保护终端采集配电网馈线线路的电流、uPMU同步测量终端采集电压测量数据，并传输到故障定位主机进行匹配，以搜寻故障点位置、隔离故障区段。与现有技术相比，本发明能够准确进行故障定位、提高配电网供电可靠性。