本发明公开了一种基于Vine Copula函数的湖泊蓝藻风险诊断方法，包括：S1：获取包含湖泊蓝藻的卫星影像；S2：对卫星影像进行预处理，得到包含研究区域的影像；S3：根据蓝藻常年的分布特征，对包含研究区域的影像进行分区处理；S4：利用FAI指数计算各分区平均蓝藻量数据，得到计算结果；S5：利用核密度估计拟合分区蓝藻量样本，得到各区对应的边缘分布；S6：根据边缘分布建立最优Vine Copula模型；S7：计算最优Vine Copula模型的联合分布函数，并将联合分布函数作为风险评价指标；S8：对比风险评价指标和传统方式获得的风险评价指标，得到蓝藻风险诊断结果。以避免传统诊断标准太过单一而导致风险诊断客观性和精度不够高的缺陷。