本发明公开了一种适用于区域电网扰动风险度预测的方法及系统，属于电力电网技术领域。本发明方法，包括：获取区域电网的原始扰动数据，对所述区域电网的原始扰动数据进行初步分类；对进行初步分类后的区域电网扰动数据进行预处理；对所述预处理后的区域电网扰动数据，进行样本归一化处理，获取训练数据；将训练数据输入卷积神经网络进行训练，获取卷积神经网络模型；使用所述卷积神经网络模型对区域电网扰动的风险度进行预测。本发明能够详细表达3/2接线的拓扑信息，并以此构建网络信息表达；且能够实现区域电网空间扰动整体风险评估与预测。