本申请提供一种能源流多联供复杂耦合转化系统及设计方法，所述系统包括：多联供能源流、多个公辅转换设备、工厂设备；所述多个公辅转换设备至少包括：电能转换设备、水能转换设备、天然气转换设备、冷流转换设备、热流转换设备、水蒸气转换设备、空气转换设备、润滑油转换设备、氧气转换设备、氢气转换设备以及蓄能转换设备；各所述公辅转换设备分别与所述工厂设备的能源输入端连接，通过与生产流耦合优化设计，实现工厂多种能源流的联合供应，并回收利用工厂设备排放的能源流。可以使得多种能源流能够有效的耦合与转化，减少多联供能源流转化与排放损失，提高工厂能源综合利用效率，保障工厂多联供能源流绿色低碳运行。