本发明涉及多肽技术领域，尤其涉及一种犁齿鲷鱼鳞抗冻肽及其筛选方法和应用。犁齿鲷鱼鳞抗冻肽，其氨基酸序列为：NAITDVVPAPK；筛选方法为：犁齿鲷鱼鳞抗冻肽初提物经质谱分析得到的肽序列；肽序列与冰晶棱面通过分子对接软件筛选得到的最优构象肽序列；三维分析下，以形成的氢键数量为指标，从最优构象肽序列筛选得到的抗冻肽序列。本发明提供的抗冻肽，弥补了犁齿鲷鱼鳞抗冻肽的空白，并且其具有高抗冻活性，可作为抗冻剂等产品的应用。本发明的筛选方法其具有简化了分离纯化等繁琐的步骤，方法简单。