一种检测肿瘤突变负荷及遗传特征的预测模型设备

    公开(公告)号:CN218811749U

    公开(公告)日:2023-04-07

    申请号:CN202222424150.8

    申请日:2022-09-14

    发明人: 王思振

    摘要: 本实用新型公开了一种检测肿瘤突变负荷及遗传特征的预测模型设备,属于肿瘤检测设备技术领域,包括检测柜和冷藏箱,所述检测柜内部底端设置有所述冷藏箱,所述冷藏箱内安装有储物屉,所述检测柜一侧壁上设置有制冷机,所述制冷机上连接有导气管;本实用新型通过设计一个由冷藏箱、储物屉、制冷机、导气管以及温度探头组成的临时储存冷藏机构,在检测过程中,冷藏箱可将需要待检测的肿瘤组织进行临时储存,同时制冷机通过导气管对其进行冷藏,并且温度探头可实时检测冷藏的温度,进而保证处于最佳温度,可使工作人员随拿随测,保证装置的检测效率,无需工作人员来回跑动,减小工作人员工作强度,提高装置实用性。

    一种智能采样的少分子数遗传序列检测装置

    公开(公告)号:CN209822284U

    公开(公告)日:2019-12-20

    申请号:CN201920042460.9

    申请日:2019-01-10

    申请人: 南昌大学

    IPC分类号: G16B30/00

    摘要: 本实用新型公开一种智能采样的少分子数遗传序列检测装置,属于遗传信息载体脱氧核糖核酸检测领域,一种智能采样的少分子数遗传序列检测装置,包括微晶颗粒双层结构模块、遗传信息载体脱氧核糖核酸分子动力模块、单电子读出模块、系统响应矩阵模块、以及遗传信息载体脱氧核糖核酸序列估计模块。本实用新型的智能采样的少分子数遗传序列检测装置具有更好的应用适应性和输入灵敏度、降低系统成本,并且具有良好的模块化特征。(ESM)同样的发明创造已同日申请发明专利

    一种海草床沉积物污染程度指标及评估方法

    公开(公告)号:CN118604282A

    公开(公告)日:2024-09-06

    申请号:CN202410643517.6

    申请日:2024-05-23

    申请人: 海南大学

    摘要: 本发明提供了一种海草床沉积物污染程度指标及评估方法,利用CCA和RDA技术,将Kazachstania菌作为海草床沉积物污染程度的指标,这是一种更为细致和灵敏的评估方法,此外,选择Kazachstania菌作为指标生物,可能与其对特定污染物质的敏感性有关,这也为海草床生态系统的监测和保护提供了新的视角和方法。该发明的应用前景广泛,可用于海洋生态环境监测、污染物排放管控、海草床生态系统保护等方面,有助于提高海洋生态系统的健康水平和可持续发展水平。

    二代测序实验智能监控系统、二代测序实验的方法和手表

    公开(公告)号:CN113837077B

    公开(公告)日:2024-09-06

    申请号:CN202111118896.X

    申请日:2021-09-24

    摘要: 一种二代测序实验智能监控系统、二代测序实验的方法和手表。该系统包括:实验室质控设备和实验手表,实验手表包括手表本体、表带和摄像头。表带两端与手表本体两端连接,以形成环形;摄像头设置在表带上;实验手表与实验室质控设备无线连接,实验人员在二代测序实验过程中佩戴该实验手表,以使摄像头朝向佩戴的手部方向,通过该摄像头记录下实验人员的手部操作图像。实验手表向实验室智能质控设备发送该实验人员的手部操作图像,实验室质控设备可以存储和/或显示该手部操作图像数据。从而使得实验操作被记录下来,实验过程可以颗粒化记录,实验过程可追溯。实验人员更好控制拍摄角度,更容易拍摄到实验人员的手部操作过程。

    一种鉴定香蕉种质资源的方法及其应用

    公开(公告)号:CN118581254A

    公开(公告)日:2024-09-03

    申请号:CN202410577915.2

    申请日:2024-05-10

    摘要: 本发明属于分子生物学技术领域,具体涉及一种鉴定香蕉种质资源的方法及其应用。本发明对现有香蕉进行测序,建立种质资源信息库。本发明发现香蕉具有复杂的遗传背景,ITS测序不能对每一种香蕉都进行很好的区分。本发明根据不同香蕉的序列信息,将香蕉分成20个分组,并鉴定出每一个分组的特征序列,通过测序可以将待鉴定香蕉分类为20个分组中的一组,可作为传统的性状观察法和基因组型鉴定法的补充,相互佐证,提高品种鉴定的效率和精度。本发明用到的香蕉种质资源包含国内外市场上流通的有代表性的香蕉品种以及常见的香蕉种质资源。该方法操作简单、准确、普适性强,对科学研究和生产上的香蕉种质资源的鉴定有实际的应用价值。

    一种基于软件分析的STR母源污染检测系统

    公开(公告)号:CN118427758B

    公开(公告)日:2024-09-03

    申请号:CN202410844460.6

    申请日:2024-06-27

    摘要: 本发明公开了一种基于软件分析的STR母源污染检测系统,具体涉及生物检测技术领域:通过建立标准参考库包括标定峰的特征数据,获取电泳图谱信息,利用自动化峰识别算法对电泳图谱中的峰进行自动识别,提取电泳图谱中峰的峰顶偏移率、峰形曲度变化速率,结合标定峰的特征数据,所述特征数据包括电泳频率偏差指数,构建异常检测模型,将峰顶偏移率、峰形曲度变化速率以及电泳频率偏差指数输入到异常检测模型中进行综合计算,根据计算结果,确定电泳图谱中的异常峰,并对异常峰所在的位置和特征进行标记,确定母源污染区域,异常检测模型的建立有助于进行质量控制,及时发现潜在的异常情况,提高实验结果的可靠性和准确性。

    高通量测序数据处理系统、装置及电子设备

    公开(公告)号:CN118571320A

    公开(公告)日:2024-08-30

    申请号:CN202410957627.X

    申请日:2024-07-17

    IPC分类号: G16B30/00 G16B40/00 G16B45/00

    摘要: 本发明公开了高通量测序数据处理系统、装置及电子设备,包括装置及电子设备模块、数据处理系统模块、高通量测序模块,装置及电子设备模块用于提供基因测序的硬件支持,提供高速、可靠的数据传输接口以及用户与系统交互界面,数据处理系统模块用于采集基因数据,对原始数据进行预处理操作后进行存储与管理并生成可视化分析报告,高通量测序模块用于构建高通量测序文库,进行生物基因测序并检测和纠正测序过程中产生的错误,本发明高通量测序数据处理系统、装置及电子设备,提出基于混合模型的高通量测序算法对生物基因进行高通量测序并对复杂数据结构进行处理,提出基于统计分析的高通量测序纠错算法对高通量测序中产生的错误进行检测并纠正。

    基于功能驱动和预训练的宏基因功能预测方法、装置及存储介质

    公开(公告)号:CN118571315A

    公开(公告)日:2024-08-30

    申请号:CN202410678198.2

    申请日:2024-05-29

    申请人: 西湖大学

    摘要: 本发明涉及一种基于功能驱动和预训练的宏基因功能预测方法、装置及存储介质,其中方法包括:获取宏基因组基因,并预处理得到氨基酸序列;将得到的氨基酸序列输入至蛋白质语言模型得到初始表征向量;将初始表征向量拼接一个方向向量得到基因表征向量;拼接多个基因表征向量得到基因组合;将得到的基因组合输入至上下文感知基因组语言编码器得到对应于基因组合内各基因表征向量的知识表示;将得到的基因组合降维得到对应于基因组合的基因表征向量的标签;基于得到的知识表示和标签构建预训练样本集,并预训练分析模型;利用预训练好的分析模型作为功能预测模型,利用功能预测样本集训练功能预测模型;利用训练好的功能预测模型进行宏基因功能预测。与现有技术相比,本发明具有可以挖掘出基因之间的相互作用和联系,从而提高宏基因功能预测的准确率等优点。

    一种基于单细胞测序数据唯一片段序列捕获方法

    公开(公告)号:CN112309500B

    公开(公告)日:2024-08-30

    申请号:CN202011200039.X

    申请日:2020-10-30

    IPC分类号: G16B30/00 G16B50/30 G06F8/30

    摘要: 本发明提供了一种基于单细胞测序数据捕获唯一片段序列的方法,其特征在于,包括以下步骤:基于单细胞测序文库中的DNA片段,以DNA片段上前10bp‑20bp碱基作为识别序列,对含有相同所述识别序列的DNA片段进行归类,通过计算机软件将同类型的DNA片段生成一个数据集,从该数据集获得用于分析单细胞全基因组唯一序列。本发明使用生物信息学手段进行数据识别,使得在基因组建库过程中无需设计和通过实验插入含有UMI的固有接头序列,简化了单细胞测序过程,并缩短了时间和降低因接头序列过长所导致的引物二聚体形成的发生概率。本方法在测序数据分析之前即可去除重复的序列,对于拷贝数变异分析而言,无其它相同的序列混杂,只剩下唯一的序列片段,即可更忠实的反应基因组的情况。

    一种用于肺癌诊断的计算机装置及其应用

    公开(公告)号:CN118547070A

    公开(公告)日:2024-08-27

    申请号:CN202410601412.4

    申请日:2024-05-15

    发明人: 王玲 王俊 狄飞飞

    摘要: 本发明公开了一种用于肺癌诊断的计算机装置及其应用。本发明提供了用于肺癌诊断的计算机装置,包括存储器、处理器及存储在存储器上的计算机程序,处理器执行计算机程序以实现如下步骤:采集A和B两类型样本的PRTN3基因甲基化水平数据,建立数学模型,确定阈值;输入待测者的PRTN3基因甲基化水平数据并代入数学模型,得到检测指数,与阈值比较,得到待测样本是A还是B类型的结论;A和B类型样本分别为肺癌和无癌对照。本发明研究发现了肺癌患者血液中PRTN3基因的低甲基化现象,本发明对提高肺癌早期诊疗效果和降低死亡率均有重要的科学意义和临床应用价值。