本发明涉及船舶防护技术领域，尤其是涉及一种船舶甲板落水管防护工装及船舶。船舶甲板落水管防护工装包括：撑托件，设置于所述落水管的内部且与所述落水管的管壁连接；所述撑托件不封闭所述落水管，且与所述船舶甲板之间设置有预定距离；防护件，嵌入所述落水管且与所述撑托件的顶部抵接；所述防护件的顶部设置有过滤部，所述过滤部形成有贯穿于其主体的滤孔，使得水能够经由所述滤孔而从所述落水管排出。本发明通过在落水管上设置防护件以及用于支撑防护件的撑托件来对落水管位于船舶甲板的一端进行防护，以在能够保证雨水或海水能够经由落水管排出的同时还能够阻挡船舶甲板上的垃圾杂质掉入落水管，从而避免落水管堵塞。