本发明公开一种硅碳复合材料的制备方法，包括：将多孔碳、有机催化剂充分混合，置于高压反应釜中；通入有机硅烷气体、有机碳源气体和氮气；升温后进行保温；降温洗涤，得到所述硅碳复合材料。本发明还公开了上述制备方法制得的硅碳复合材料和在锂离子电池的应用。本发明在沉积过程中同时加入硅源气体和碳源气体，使得硅、碳共沉积，具有均匀性高、结构稳定的特性，同时避免团聚等不利影响；沉积时使用氮气增加压力，降低其硅的膨胀，提升高温性能，得到的硅碳分散均匀性好，反应进程快；掺杂有机催化剂，可以降低硅晶粒的膨胀，提升材料的反应速度，降低杂质含量的引入。