本发明公开了一种复合抗菌剂，其配方中包括以下重量百分比的组分：有机抗菌剂2.5％‑4％、壳聚糖0.8％‑1.2％、甲基苯并三氮唑0.1％‑0.2％、无机抗菌剂0.2％‑0.5％，剩余为去离子水；其中有机抗菌剂至少包括聚六亚甲基胍盐酸盐，聚六亚甲基胍盐酸盐在复合抗菌剂中的含量为0.5％‑1％。本发明还公开了上述复合抗菌剂的制备方法。本发明通过组分间的协同作用，使溶液中存在更稳定的有机抗菌基团和分散性好的无机金属阳离子，提高了抗菌性。