本发明属于生物工程技术领域，具体指涉及一种鮸鱼鱼鳔寡肽及其制备方法和用途。本发明以鮸鱼鱼鳔为原料，通过超声脱脂、复合酶解，超滤膜分级和色谱制备得到二肽基肽酶Ⅳ(DPP‑Ⅳ)抑制寡肽Glu‑Gly‑Pro‑Gly‑Trp‑Ser(EGPGWS)，质谱测定其分子量为631.6Da。本发明EGPGWS可显著地抑制二肽基肽酶Ⅳ(DPP‑Ⅳ)活力，降低模型小鼠的餐后血糖水平，提高小鼠口服葡萄糖糖耐量和麦芽糖糖耐量，降低模型小鼠的甘油三酯(TG)和胆固醇(TC)的水平，且安全无毒副作用。本发明EGPGWS可应用于制备治疗或者辅助治疗糖尿病的特医食品、保健品和药物。