本发明涉及一种能够上下取片的平板玻璃垂直堆垛机及其运行控制方法，包括玻璃输送机构、吸盘机构、上取片驱动装置和下取片驱动装置，上取片驱动装置包括用于带动和控制吸盘架运动的上抓摆臂和上抓连杆，下取片驱动装置包括用于带动和控制吸盘架运动的下抓摆臂和下抓连杆，上抓摆臂和下抓摆臂都与吸盘架铰接，还包括切换装置，切换装置包括上抓离合器和下抓离合器，上抓离合器包括能够吸合或者分开的第一离合部和第二离合部，所述第一离合部与上抓连杆固定连接，第二离合部与吸盘架固定连接，下抓离合器包括能够吸合或者分开的第三离合部和第四离合部，所述第三离合部与下抓连杆固定连接，第四离合部与吸盘架固定连。