本发明属于电力工程技术领域，公开了一种抗干扰的电力变压器短路冲击分析系统及方法，该系统包括短路冲击管控数据库、录波读取模块、冲击分析模块、干扰识别模块和终端接收模块；所述干扰识别模块对电流通道状态变量的标记为F的电流通道设置五个串行判据；该方法通过电流采样值计算确定电流突变时刻，并更改电流通道状态变量的标记，然后根据短路电流比更改电流通道状态变量的标记，对电流通道状态变量的标记为F的电流通道设置五个串行判据，将经干扰识别模块处理的故障录波反馈回短路冲击管控数据库，根据管控要求设定短路电流比的注意值、预警值和异常值。本发明实现了变压器短路冲击数字化分析。