本发明公开了一种面向跨境运输模块化箱体的行程时间预测方法，方法包括：获取模块化箱体陆路运输和海路运输的行程数据，包括距离和速度信息；获取其他行程数据，包括模块化箱体装卸作业时间和运输工具周转等待时间以及运输路线的天气信息；将天气条件依据恶劣程度划分等级；计算天气对跨境运输模块化箱体各过程的影响作用，包括恶劣天气对运输时间的影响和风力对吊装时间的影响；建立行程时间模型计算模块化箱体跨境运输的行程时间。本发明提供的方法综合考虑运输全流程的影响因素，对跨境运输模块化箱体的行程时间预测结果更准确，进而为海外箱体施工提供科学合理的运输规划，为施工生产提供理论保障。