本发明公开了一种船舶冷却水供水系统设计方法及供水系统，涉及船舶动力装置设计技术领域，该方法包括：将需求水量与管道阻力比值在设定值以下的用户划分入增压区；根据增压区用户的需求水量和所需扬程，确定增压泵的规格；将增压泵串联在增压区的总管上，用于满足增压区用户的扬程需求。只需要对少量高阻力用户进行增压，提供给其他用户的扬程可维持不变，因此系统输入的功率可大幅减少，运行效率更高。采用混合‑分区供水模式，通过混合供水统一泵组参数，减少泵组类型，利用分区供水降低主泵组运行功率。解决了现有技术中为满足少部分低水量高阻力用户的扬程需求，水泵需工作在大功率，造成系统供水效率低，能耗高的问题。