本发明提出一种核酸分子杂交仪程序组件的控制方法及系统，涉及网络应用的技术领域，首先，运行核酸分子杂交仪本地程序组件，确认程序组件合法性，程序组件由自定义的多个段组成，含有命令域和参数域，采用明文语言描述，便于调整；然后对程序组件进行解析，将核酸分子杂交自动化过程封装于程序组件中，将程序组件的各个段的命令域与核酸分子杂交仪的逻辑框架表进行匹配，编译产生核酸分子杂交仪的指令集，最后执行指令集中的指令，并根据需求，适时进行交互，逻辑框架表通俗易懂，整个实现核酸分子杂交仪程序组件的控制过程易读、易调整，无需程序员调整代码的自动化控制，适合非从事专业程序工作的现场生物技术人员和实验员使用。