本发明公开了一种基于深度学习的食品真空小包装缺陷检测系统，该系统包括图像采集模块、图像处理模块和运动控制模块；图像采集模块用于通过工业相机获取传送带上的食品真空小包装的图像；图像处理模块部署在工控机上，用于接收图像采集模块传送的图像，利用基于深度学习的目标检测算法对图像进行缺陷包装的检测与定位，并在检测到缺陷包装后向运动控制模块传递缺陷包装的位置信息；运动控制模块用于剔除图像处理模块检测出的缺陷包装。本发明克服了传统的人工筛选缺陷包装效率低下、漏检率高的缺点，使用改进的深度学习方法进行缺陷包装的检测和剔除，检测效率高、检测精度高、人工成本低。