本发明提供了一种三维结构化金属硒化物柔性热电材料及其制备方法和应用，该制备方法包括如下步骤：将柔性基体用碱溶液进行前处理，清洗后得到基体材料；将锡盐溶于水中制成Sn2+溶液，然后加入酸至溶液变澄清后，将基体材料浸入该澄清的溶液中10min以上，然后清洗干燥，得到模板；在所述模板的表面和模板孔洞内表面沉积金属X，得到金属化后的基体；其中，X为Cu、Ag、Sn中的至少一种；将金属化后的基体浸入硒溶液中浸泡，反应得到三维结构的XnSe金属硒化物柔性热电材料，其中2≥n≥1。采用本发明的技术方案，得到的热电材料具有高孔隙率、低的密度、低热导和优异的柔性。