本发明涉及数字医疗技术领域，揭露了一种获取缺失牙咬合关系的数字扫描方法，包括：对包含咬合介质的口内环境进行扫描，得到扫描图像；根据扫描图像重建口内环境的上颌三维形貌数据、下颌三维形貌数据以及咬合介质三维形貌数据；根据上下颌以及咬合介质形貌数据重建上下颌与咬合介质之间的咬合介质空间变换关系；根据咬合介质空间变化关系生成上下颌之间的上下颌空间变化关系；根据上下颌空间变换关系对上下颌三维形貌数据进行咬合匹配，得到口内环境的咬合关系。本发明还提出一种获取缺失牙咬合关系的数字扫描装置、电子设备以及介质。本发明可以提高上下颌咬合关系扫描的精确度。