本发明公开了一种珊瑚礁底栖生物群落原位监测装置及其安装方法，所述原位监测装置包括安装底板，所述安装底板的顶部设置有四条安装柱，所述安装柱上按预设间隔固定安装有若干片生态板，所述生态板与安装柱之间构成生态模拟架，且相领的两片生态板之间形成生态模拟腔，所述生态板上开设有通孔，所述安装底板上固定安装有单向透光罩，且所述单向透光罩穿过每一片生态板的通孔伸出至所述生态模拟架的顶部，通过全息摄像头定期的拍摄各层生态模拟腔内所存在的动物图像情况，以使得研究人员能够根据这些图像信息分析和掌握珊瑚礁生物的多样性、分布、丰富度以及群落结构，从而实现了长时间尺度的原位在线监测功能。