本发明公开了一种组合件装配精度控制方法，包括以下步骤：分析组合件装配时需要控制的结构尺寸，确定重点保证尺寸的精度要求；根据重点保证尺寸的精度要求，结合重点保证尺寸的实际测量数据，获得重点保证尺寸的误差值；将重点保证尺寸的误差值写入到数控系统的补偿模块中，数控系统调用补偿模块的指令，修正用户的加工代码，完成误差补偿。该组合件装配精度控制方法，通过确定重点保证尺寸的精度要求，与实际数据进行比较，获得重点保证尺寸的误差值，并与数控系统相结合，能够实现重点保证尺寸的误差补偿，使得机床加工的零件重点尺寸得以保证，以使装配精度符合要求。